Кошки монтажные: Монтёрские когти, лазы и кошки электрика для лазания по столбам купить по низкой цене – интернет-магазин ВсеИнструменты.ру

«%d0%9c%d0%be%d0%bd%d1%82%d0%b0%d0%b6%d0%bd%d1%8b%d0%b5 %d0%9a%d0%be%d0%b3%d1%82%d0%b8 %d0%9a%d0%be%d1%88%d0%ba%d0%b8» на интернет-аукционе Мешок

Ирландия годовой набор евросет 1,2,5,10,20,50 центов, 1 и 2 евро 2002 г. 8 монет. АНЦ 3.88 евро UNC 899.00 р. Санкт-Петербург    120.00 р 2 штуки продано Продавец: mench (3544)
Вкладыш от жвачки BomBibom мото 1-40 b (6 серия) №5 15.00 р.  0 ставок Красноярск    60.00 р Окончание торгов: 04/11 11:35 Продавец: artas81 (3303)
Вкладыш от жвачки BomBibom мото 1-40 b (6 серия) №5 2 20.00 р.  0 ставок Красноярск    80. 00 р Окончание торгов: 04/11 11:35 Продавец: artas81 (3303)
0.95ct VVS ДИАСПОР (СУЛТАНИТ) НАТУР. 5.6x5x3.5мм 2700.00 р.  0 ставок Чехов    200.00 р Окончание торгов: 23 часа Продавец: SERGE63 (1647)
1.41КТ 6.8X6.9mm ПРИРОДНЫЙ БРИЛЛИАНТ РОЗА RS26 56.00$ Москва    10.00$ Окончание торгов: 16/11 19:12 Продавец: dvp1974 (5557)
1,2,4,6,8 пенсов и 1 шиллинг Новый Южный Уэлс (В-3, серия 100 лет колонии) 1888-1889 год 590.00 р. Торг уместен Москва     самовывоз Продавец: оldсity49 (20220)
6. 36ct ПРЕНИТ КАБОШОН НАТУР. 11.1 X 13.6 X 5.8мм 800.00 р.  0 ставок Чехов    200.00 р Окончание торгов: 12 часов Продавец: SERGE63 (1647)
1 марка 1955г. Финляндия снг-6-8-5 15.00 р. Москва    самовывоз Продавец: Сергей 999 (1705)
1 песета una peseta (1971г.) образца 1966г. Испания а-6-8-5 45.00 р. Москва     самовывоз Продавец: Сергей 999 (1705)
№9а. МОРЯК. СТИЛЬ ОДЕЖДЫ. ФУРАЖКА. ФОТО: 14х8,5см 40.00 р.  0 ставок Самара    75. 00 р Окончание торгов: 16 часов Продавец: Самарчанка (3582)
9-118 Южная Родезия 1 пенни 1944г. КМ # 8а бронза 200.00 р. Москва    60.00 р Продавец: Alex7778887 (6116)
9-137 Южная Родезия 1 пенни 1947г. КМ # 8а бронза 200.00 р. Москва     60.00 р Продавец: Alex7778887 (6116)
9-144 Южная Родезия 1 пенни 1947г. КМ # 8а бронза 200.00 р. Москва    60.00 р Продавец: Alex7778887 (6116)
9-18 Южная Родезия 1 пенни 1944г. КМ # 8а бронза 200. 00 р. Москва    60.00 р Продавец: Alex7778887 (6116)
9-38 Южная Родезия 1 пенни 1943г. КМ #8а бронза 200.00 р. Москва    60.00 р Продавец: Alex7778887 (6116)
Первый инвестиционный ваучерный фонд Свидетельство на 5 акций 3-го выпуска Биробиджан (1) 350.00 р. Биробиджан    70.00 р Окончание торгов: 31/10 13:52 Продавец: phоtоmuseum (986)
Первый день на конверте с ОМ 8 шт. лот №3 200.00 р.  0 ставок Геленджик    80.00 р Окончание торгов: 1 день Продавец: nik9980 (831)
Первый инвестиционный ваучерный фонд Свидетельство на 5 акций 3-го выпуска Биробиджан (2) 350. 00 р. Биробиджан    70.00 р Окончание торгов: 31/10 13:53 Продавец: phоtоmuseum (986)
стабилитрон BZX55C6V8 6.8В, 5%, 0.5Вт (DO-35) 2.00 р. Пятигорск    265.00 р Окончание торгов: 22 часа Продавец: Вячеслав_79 (5425)
БУКЛЕТ DOLLY DOTS’ 80-’82 ОТ ЯПОНСКОГО ИЗДАНИЯ, 8 СТРАНИЦ. 28-3 P-311. 400.00 р. Киров    договорная Окончание торгов: 01/11 17:08 Продавец: metallia (2391)
Уточните поиск:  5 копеек CCCP UNC Англия винтаж вторая мировая война Германия Германская Империя дешево животные золото иностранные монеты коллекционирование коллекция космонавтика КПД набор недорого нечастая новая новый нумизматика оригинал Оригинал отличное состояние подарок почтовые марки Почтовые марки президент природа пруф птицы Редкая монета редкие редкость Российская Империя серебро серия марок состояние сохран СССР США фауна Фауна филателия чистая чистые марки экзотика эмаль юбилейные Еще. ..
Германия Данциг. 1920. 8 марок из серии. Mi 1, 2b-6, 12b гашеные; Mi 7 чистая со следами наклейки* 1200.00 р.  0 ставок Ржев    100.00 р Окончание торгов: 1 день Продавец: codex (683)
MERCEDES-BENZ C 36 AMG W202 SPARK 1 43 B6 604 0527 2499.00 р.  0 ставок Казань    501.00 р Окончание торгов: 1 день Продавец: Александр1667 (254)
Сверло 9,0 В1 мм Р6М5К5 Конус 1 300.00 р. Орел    договорная Окончание торгов: 02/12 11:26 Продавец: Н80Х20 (441)
Сверло с коническим хвостовиком 7,0В1-2 шт+6,8В1-2 шт с хранения СССР. 4 штуки одним лотом. 150.00 р. Белая Калитва    250.00 р Окончание торгов: 28/11 21:25 Продавец: sergo56 (1192)
К 10531 Космос ЙАР 7 марок 945-51 Восход-1-2 Восток-1-2-3-4-5-6 Союз-1 Комаров MNH Mi-8.5euro 255.00 р. Екатеринбург    70.00 р Окончание торгов: 15/11 08:49 Продавец: aalex1 (3667)
К 12291 Космос ЙАР 7 марок 945-51 Восход-1-2 Восток-1-2-3-4-5-6 Союз-1 Комаров MNH Mi-8.5euro 255.00 р. Екатеринбург    70.00 р Окончание торгов: 15/11 08:49 Продавец: aalex1 (3667)
колокольчик колокол звонок 4 шт бронза подвес одним лотом перезвон диаметр 8 6.8 5.8 4.3 см рында 8950.00 р.  “>Торг уместен Армавир    350.00 р Окончание торгов: 04/12 20:03 Продавец: andreas196767 (1522)
Сингапур – 1 доллар 1971 год – 0,9 млн экз – статуя сингапурского льва – КМ 6 500.00 р. Стрежевой     200.00 р Продавец: Alias76 (1783)
2 Радиолампы 15 штук 6п13с, 6ф4п, 6ф5п 3 шт, 6п14п, 6н1п, 6ф1п 3 шт, 6д20п, 6с10п, 1960-1980 годы 500.00 р. Москва    самовывоз Окончание торгов: 02/12 12:26 Продавец: BlackBeard (1507)
РАСПРОДАЖА! РЕДКОСТЬ! 1/66 Кт 6.8 X 8.6 X 3.1 мм Натуральный солнечный камень кабошон Орегон США 299. 00 р.  0 ставок 3500.00 р.  блиц-цена Бангкок    750.00 р Окончание торгов: 13 часов Продавец: Your World Jewelry (2030)
Всеобщая история искусств в 6 т. Книги 2(2),6(1),6(2),5. Д3/Z1 2444.00 р.  0 ставок Москва    договорная Окончание торгов: 16/11 19:13 Продавец: UDARNIK-2 (1229)
Конденсатор К52-1В 6,8мкф × 25в 10% 88г (36) 130.00 р. Смоленск    350.00 р Окончание торгов: 22/12 10:16 Продавец: геннадий111 (1187)
Ватикан официальный годовой набор 2017 г. 8 евро монет (3,88 евро) в буклете UNC 4680.00 р. Москва    самовывоз Окончание торгов: 2 часа Продавец: Evgeny1970 (5465)
Сверло с коническим хвостовиком 8,8В1-2 шт+6,8В1-2 шт с хранения СССР. 4 штуки одним лотом. 150.00 р. Белая Калитва    250.00 р Окончание торгов: 28/11 11:03 1 штука продана Продавец: sergo56 (1192)
Сапфир нежно голубой НЕЗАБУДКА Цейлон овал 0,75 карат 5,6х5х 3 6178.00 р. Ступино    300.00 р Окончание торгов: 13 часов Продавец: Odmi new (500)
Тачскрин (сенсорное стекло) ZTE Blade AF3/AF5/A3/A5/A5 Pro 550. 00 р. Брянск    150.00 р Окончание торгов: 14 часов Продавец: Андрей032 (1561)
Кабель For Alpine M-bus KCM-123B CD 8 Pin to Aux 3.5MM Jack Auxiliary Line in Cable Adapter 150.00 р. Белгород    договорная Окончание торгов: 25/11 23:26 Продавец: Targia (145)
Аккумулятор ZTE Blade A5/AF5/A3/A5 Pro/AF3 230.00 р. Москва    250.00 р Окончание торгов: 03/11 21:28 Продавец: SUMRAK__ (1876)
СБОРНИК (MP3) – D.I.S.C.O. МУЗЫКАЙФ 90-Х, РУССКАЯ ВЕРСИЯ (E.-ARK.) (MP3) 179.00 р. Ярославль    договорная Продавец: Лесенка (1165)
Югославия 10 динар 1968 г. № 82b/ 6 цифр​ UNC​ 150.00 р. Москва    договорная Окончание торгов: 14/11 09:30 Продавец: marina_mo-skwa (384)
Югославия 10 динар 1968 г №82b (6 – значный номер) UNC 148.00 р. Москва    самовывоз 3 штуки продано Продавец: numfil (2204)
Мальта годовой набор 2017 г: 1,2 5,10,20,50 центов, 1,2 евро. Монеты АНЦ. Буклет, блистер. 3,88 евро 1495.00 р. Санкт-Петербург    120.00 р Окончание торгов: 03/11 09:05 Продавец: mench (3544)
Мальта годовой набор 2016 г: 1,2 5,10,20,50 центов, 1,2 евро. Монеты АНЦ. Буклет,блистер. 3,88 е UNC 1495.00 р. Санкт-Петербург    120.00 р Окончание торгов: 12 часов Продавец: mench (3544)
Сопло 0,4мм из латуни – нить 1.75 мм MK8 20.00 р. Ижевск    210.00 р Окончание торгов: 19/12 15:54 Продавец: r.a.v.71 (1244)
Исаакиевский собор 16 фото 5,5х8.5 см 3.1.1969 Лик 330.00 р.  0 ставок 410.00 р.  блиц-цена Харьков    310.00 р Окончание торгов: 05/11 09:47 Продавец: GeorgiySh (8749)
резистор БЛП-0.1 сопротивление R 6. 8 Ом из СССР 1970 год 180.00 р.  0 ставок Москва    самовывоз Окончание торгов: 02/11 20:20 Продавец: ingwarst (1711)
ЗНАК ЗА ОТЛИЧНУЮ АРТИЛЛЕРИЙСКУЮ СТРЕЛЬБУ TM 6,8 НА 5,3 СМ БРОНЗА ПРЕДПОЛОЖЕНИЕ 15000.00 р.  0 ставок Сызрань    200.00 р Окончание торгов: 03/11 10:55 Продавец: MEGADOM (4014)
Журнал ЧЕЛОВЕК и ЗАКОН 9шт. (одним лотом) №2,6,7,12 1977г №3,7,12 1973г №7-1974г №1-1971г. 100.00 р. Ярославль    190.00 р Продавец: prostoi123 (14407)
Сверло 14,0 В1 мм Р6М5 Конус 1 400. 00 р. Орел    договорная Окончание торгов: 04/12 09:07 Продавец: Н80Х20 (441)
1969 Монголия картины из национального музея 6 из 8 негаш Mi 3.5е. 80.00 р. Торг уместен Балашов    50.00 р Окончание торгов: 07/11 03:45 Продавец: Alex61 (597)

Когти (лазы) монтерские, когти электрика, когти для столбов

      

 

  Когти лазы монтерские, когти электромонтажные

    Монтерские когти и лазы – это вспомогательное изделие, предназначенное для поднятия специалистом электромонтажных работ на столб электропередачи или телефонные столбы. Изделие представляет собой крюки зажимные с платформой одеваются на ногу специалиста, застегиваются когти и лазы монтерские как сандалии, пятка-носок, что достаточно надежно фиксирует ногу специалиста. Работают монтажные лазы за счет веса монтажника, который воздействуя на когти монтерские и лазы удерживает специалиста электромонтажных работ в вертикальном положении относительно столба, а зубчики на концах лазов более надежно удерживая специалиста в вертикальном положении врезаясь в тело столба. Изготавливается лазы когти монтерские из высокопрочной углеродистой стали, что влияет на вес лазов – лёгкость, возможность выдерживать большие нагрузки – прочность.

Материалы изготовления

Лазы и когти монтерские изготавливают из углеродистой стали, для более высокой прочности кристаллической решетки когти монтёрские подвергают термической обработки, а для защиты металлических элементов лазов от коррозии, покрывают лакокрасочным покрытием (грунтуют покрывают краской). Шипы износостойкие для придания им необходимых механических свойств – прочность детали, подвергают элементы термической обработкой. Ремни крепежные на когти монтерские лазы производят – из двух цельных кусков кожи юфтевой и кожи сыромятной, что дает надежность и плотное облегание ступней специалиста, а изделие предает долговечности в эксплуатации. Изделия изготавливаются согласно – ТУ 14307699.027-96.

Назначение монтажных когтей для столбов

Лазы монтерские ЛМ-2 – кошки монтерские предназначены для работы на деревянных столбах с железобетонными приставками и деревянных опорам линий электропередач 0,4кВ и 10кВ, на линиях связи и радиофикации диаметром 140-250 мм.

Лазы монтерские ЛМ-3М- предназначены для подъема на железобетонные опоры трапециидального сечения типа СВ-105 и СВ-95 линий электропередачи и работы на них.

Лазы монтерские ЛМ-ЗУ – для подъема и выполнения работ на железобетонных опорах линий электропередач трапецеидального сечения типа СВ-105 (10кВ) и СВ-95 (0,4кВ)

    Купить лазы для столбов Вы можете сформировав заказ на сайте или же связаться с нашим отделом сбыта через раздел контакты.

    Стоимость монтажных лазов с доставкой зависит от массы посылки, тарифа автоперевозчика, а так же удаленности города покупателя от склада «CARGOSET»

 

Кошка для тали, механизм передвижения ручной тали “Кошка”

Ручное перемещение передвижной тали по монорельсу обеспечивает специальный механизм, который в профессиональной среде называется по-простому «Кошка». Данное изделие «цепляется» к монорельсу и легко перемещается по двутавровой балке посредством цепного привода. Кроме того, возможно перемещение тележек ручных талей перетаскиванием кареток за специальный трос. В компании «Кранталь М» вы можете в ближайшее время заказать надежный и долговечный механизм для ручной тали с гарантией качества и безопасности от производителя. Купленные у нас «кошки» не подводят в условиях реального использования. Технические характеристики Модель Грузоподъемность, т Тяговое усиление, кгс, не более Масса тали с цепями при высоте (Н) подъема, кг, не более Масса (без цепей), кг, не более Н=3 м Н=6 м Н=9 м Н=12 м Кошка 0,5 т 0,5 – – – – – 4 Кошка 1 т 1 10 13 16,7 20,4 24,1 10 Кошка 2 т 2 15 21 24,7 28,4 32,1 18 Кошка 3,2 т 3,2 18 35 38,7 42,4 46,1 32 Размеры Модель H B b L S b1 h Двутавровые балки по ГОСТ 8239 мм, не более мм, не менее № ширина полки, мм Кошка А- 0,5 180 100 100 150 34 15 45 14-24 73-115 Кошка Б-1 180 185 125 170 42 15 55 16-27 81-130 Кошка Б-2 245 175 125 245 40 15 55 20-30 100-135 Кошка Б-3,2 280 200 140 355 65 15 70 22-36 110-150

Выбирая подходящий механизм передвижения ручной тали, следует знать, что «кошки» отличаются:

• по грузоподъемности;      
• по высоте подвеса тали;
• по варианту исполнения и габаритам.

Следует также руководствоваться характеристиками балки для монорельса, предназначенной для установки механизма передвижения ручной тали.

Чтобы не ошибиться в выборе, позвоните специалистам компании «Кранталь М» по телефону, указанному на сайте нашей компании. Кроме того, вы можете воспользоваться кнопкой обратного звонка. Нам также можно отправлять заявки по электронной почте.

Мы обязательно предоставим исчерпывающие ответы на все интересующие вас технические вопросы. Менеджер сайта уточнит вариант доставки механизма по указанному вами адресу, а также пояснит алгоритм оплаты заказа.

Строительно-монтажные работы по объекту капитального строительства; «Детский сад на 80 мест в селе Кошки Кошкинского района Самарской области», расположенного по адресу: 446800, Самарская область, Кошкинский район, с. Кошки, ул. Парковая, 1Д»

52 873 845,96 ₽

Обеспечение заявки

2 643 692,30

Обеспечение договора

2 643 692,30

Место поставки: В соответствии с требованиями документации

Подача заявок завершена

Взять в работу

ОАО ”Красногвардейский крановый завод”, Красногвардейский

ОАО ”Красногвардейский крановый завод” производит грузоподъемное оборудование, рассчитанное на массу от 0,5, до 20 тонн. Специализация завода – мостовые электрические и ручные краны, электрические краны-штабелеры, ручные червячные тали, тягово-монтажные механизмы, кошки. Так же, в последнее время, завод производит шахтные вентиляторы, как главного, так и местного проветривания.
Завод оказывает покупателям дополнительно следующие услуги:
Монтажные и шеф-монтажные работы, связанные с монтажом оборудования собственного производства.

Услуги производства, в частности:
– механическая обработка деталей типа валов диаметром до 500мм и длиной до 5,5м; зубчатых колес диаметром до 400мм и модулем 8; фрезерные, строгальные работы по обработке деталей с наибольшими размерами: ширина 1000мм, длина 1500мм, высота 600мм;
– производство чугунного литья С4-18 весом до 400кг;
– производство цветного литья (сплавов на основе алюминия и меди) весом до 150кг;
– изготовление различных сварных металлоконструкций.

Продукция и услуги компании:

Грузоподъемное оборудование: 

• Лебедка электрическая тяговая ТЭЛЗ г/п 3,2 т.
• Кошка тип А и Б
• Тали ручные червячные
• Краны мостовые ручные
• Краны мостовые электрические
• Краны консольные
• Кран козловой ручной передвижной г/п 1,0 т

Вентиляторное оборудование:

• Вентилятор шахтный местного проветривания ВМЭ-5, ВМЭ-5-01
• Вентилятор шахтный местного проветривания ВМЭ-6, ВМЭ-6-01
• Вентилятор шахтный местного проветривания ВМЭ-8, ВМЭ-8-01
• Вентилятор шахтный местного проветривания ВМЭ-12А
• Вентилятор осевой ВО 16
• Вентилятор осевой ВО 16А
• Дымосос Д-18
• Пылеуловитель комбинированный ПК 35
• Вентилятор центробежный ВЦ 15
• Вентилятор центробежный ВЦ 11
• Вентилятор газоотсасывающий шахтный местного проветривания ВЦГ 7А
• Вентилятор газоотсасывающий шахтный местного проветривания ВЦГ 9М
• Вентилятор радиальный ВДПБ-5, ВДПБ-5-01
• Вентилятор дутьевой ВД 18
• Дымосос ДН 19
• Дымосос ДН 19НЖ и дутьевой вентилятор ВГДН 19
• Дымосос центробежный двухстороннего всасывания Д-21, 5х2Б
• Дымосос цементный ДРЦ-21×2
• Вентилятор осевой ВО 11
• Вентилятор осевой двухступенчатый ВОД 11П
• Вентилятор осевой ВОM 24
• Шахтный осевой вентилятор главного проветривания ВО-21К
• Вентилятор осевой двухступенчатый реверсивный ВОД 16П
• Вентилятор осевой двухступенчатый реверсивный ВОД 21М
• Вентиляторы центробежные В1М, В2М, В2МЛС
• Вентилятор центробежный ВЦ 25М
• Вентилятор центробежный проходческий ВЦП 16
• Вентилятор шурфовой центробежный ВШЦ 16
• Вентилятор газоотсасывающий шахтный ВЦГ 15
• Вентилятор радиальный ВДПЭ-4
• Вентилятор радиальный В-3
• Установка вентиляторная центробежная газоотсасывающая УВЦГ9
• Вентилятор циркулярный к установке УЦВ 2225
• Вентилятор циркулярный к установке УЦВ 1322
• Агрегат мокрого пылеулавливания ПМ 35А
• Комплект средств переключения потока к вентиляторам ВОД-21М
• Вентилятор шахтный местного проветривания ВМЭ-2-10А, ВМЭ-2-10А-01
• Вентилятор шахтный местного проветривания ВОЭ-5, ВОЭ-5-01
• Вентилятор радиальный ВКПЭ-4
• Дымосос двухстороннего всасывания ДН-26х2-0,62

Лесохозяйственная техника: 

• Плуги
• Культиватор
• Устройство навесное

Возникли вопросы?

Нужна консультация?

Свяжитесь с нашими специалистами, они помогут вам:

— подобрать оптимальный кран и оборудование для него в соответствие с вашими задачами и по оптимальной цене;

— рассчитать все накладные расходы на доставку и монтаж крана;

Звоните 8 (800) 30-20-210, оставляйте заявку на обратный звонок или опишите ваш запрос:

Amazon.

com: когтеточка для кошек 3-в-1 Paws & Pals с гамаком и игрушкой | Легкая сборка, прочное прессованное дерево с веганским меховым ковром – кровать для домашних животных Scratch Lounge Мебель Лучшая для котят и больших кошек

5.0 из 5 звезд Превзошел мои ожидания, и моему большому коту это нравится.
By G 13 июня, 2018

Я получил это, чтобы поставить кошке вертикальную когтеточку в надежде, что он оставит мебель в покое.Кровать-гамак наверху меня не волновала, потому что мой большой мальчик не интересовался лежанками для кошек; он любил спать, вытянувшись на два фута в длину. Что ж, теперь он не только оставляет мою мебель в покое, вместо использования сизалевых когтеточек, но и остается его любимым местом для сна.

Прочитав некоторые другие обзоры, я не ожидал, что игрушечный пушистый мяч устоит, но он уже 6 месяцев злоупотреблял и все еще на месте. Кровать кажется немного шаткой, но до сих пор она без проблем выдерживала прыжки в воздух и другие тяжелые нагрузки.

Это дерево / кровать для кошек было очень легко собрать. Я инвалид и не очень силен, и я смог сделать это сам, сидя на стуле, и это заняло всего несколько минут. Столбы сизаля колючие, чтобы удерживать их; вы можете надеть перчатки, если это вас действительно беспокоит.

Мне бы очень хотелось, чтобы он был доступен в темном цвете, поскольку черный мех моей кошки имеет тенденцию делать его тусклым (хотя он легко очищается с помощью быстрой уборки пылесосом). Единственный другой недостаток состоит в том, что Майло настаивает на том, чтобы кресло садилось рядом с моим стулом, и поднимает шум, если я его передвигаю.

В целом, это превзошло мои ожидания и оказалось выгодной сделкой, а также спасло мою мебель от царапин.

ОБНОВЛЕНИЕ: у меня это уже больше года, и оно все еще хорошо держится. Мяч все еще прикреплен (хотя, честно говоря, он не играет с ним так часто, как сначала). Он до сих пор использует его как свою любимую когтеточку. Я снова затянул винты один раз, когда он начал шататься. Я до сих пор доволен этой покупкой.

ОБНОВЛЕНИЕ 2: Первый, который я купил, продержался 3 года до того, как начал отрываться сизаль.Второй продлился всего около 7 месяцев. Но я вернулся, чтобы купить третий, потому что моему коту это нравится, и он мешает ему царапать мебель. Его водят танцевать на шесте на столбах. Я только надеюсь, что этот держится лучше.

Исследование окрестностей в больших графах сборки метагенома с помощью spacegraphcats обнаруживает скрытое разнообразие последовательностей | Геномная биология

1

Айва К., Уокер А. В., Симпсон Дж. Т., Ломан Н. Дж., Сегата Н. Метагеномика дробовика, от отбора проб до анализа. Nat Biotechnol.2017a; 35 (9): 833–44. https://doi. org/10.1038/nbt.3935.

2

Пелл Дж и др. Масштабирование сборки последовательности метагенома с помощью вероятностных графов Де Брейна. PNAS. 2012; 109 (33): 13272–7. https://doi.org/10.1073/pnas.1121464109.

CAS Статья Google ученый

3

Laczny CC, Kiefer C, Galata V, Fehlmann T., Backes C, Keller A. Busybee web: анализ метагеномных данных с помощью начального контролируемого биннинга и аннотации.Nucleic Acids Res. 2017: gkx348. https://doi.org/10.1093/nar/gkx348.

4

Линь Х., Ляо Ю. Точное объединение метагеномных контигов с помощью автоматической кластеризации последовательностей с использованием информации о геномных сигнатурах и маркерных генах. Sci Rep.2016; 6: 24175.

CAS Статья Google ученый

5

Parks DH, Rinke C, Chuvochina M, Chaumeil P-A, Woodcroft BJ, Evans PN, Hugenholtz P, Tyson GW. Восстановление почти 8000 геномов, собранных из метагеномов, существенно расширяет древо жизни. Nat Microbiol. 2017; 2 (11): 1533–42. https://doi.org/10.1038/s41564-017-0012-7.

CAS Статья Google ученый

6

Талли Б.Дж., Грэм Э.Д., Гейдельберг Дж.Ф. Реконструкция 2631 проекта генома, собранных из метагеномов из Мирового океана. Научные данные. 2018; 5: 170203. https://doi.org/10.1038/sdata.2017.203.

CAS Статья Google ученый

7

Стюарт Р.Д., Аффрет, доктор медицины, Варр А., Уайзер А.Х., Пресс М.О., Лэнгфорд К.В., Лячко И., Снеллинг Т.Дж., Дьюхерст Р.Дж., Уокер А.В., Рохе Р., Уотсон М.Сборка 913 микробных геномов из метагеномного секвенирования рубца коровы. Nat Commun. 2018; 9 (1). https://doi.org/10.1038/s41467-018-03317-6.

8

Delmont TO, Quince C. Shaiber, Esen ÖC, Lee STM, Rappé MS, McLellan SL, Lücker S, Eren AM. Азотфиксирующие популяции планктомицетов и протеобактерий многочисленны в поверхностных метагеномах океана. Nat Microbiol. 2018; 3 (7): 804–13. https://doi.org/10.1038/s41564-018-0176-9.

CAS Статья Google ученый

9

Hug LA, Baker BJ, Anantharaman K, Brown CT, Probst AJ, Castelle CJ, Butterfield CN, Hernsdorf AW, Amano Y, Ise K, Suzuki Y, Dudek N, Relman DA, Finstad KM, Amundson R, Томас BC, Банфилд JF.Новый взгляд на древо жизни. Nat Microbiol. 2016; 1 (5). https://doi.org/10.1038/nmicrobiol.2016.48.

10

Pasolli E, Asnicar F, Manara S, Zolfo M, Karcher N, Armanini F, Beghini F, Manghi P, Tett A, Ghensi P, Collado MC, Rice BL, DuLong C, Morgan XC, Golden CD, Айва К., Хаттенхауэр С., Сегата Н. Обширное неизученное разнообразие микробиома человека, выявленное более чем 150 000 геномов из метагеномов, охватывающих возраст, географию и образ жизни. Клетка. 2019; 176 (3): 649–62.e20. https: // doi.org / 10.1016 / j.cell.2019.01.001.

CAS Статья Google ученый

11

Sczyrba A, Hofmann P, Belmann P, Koslicki D, Janssen S, Dröge J, Gregor I, Majda S, Fiedler J, Dahms E, Bremges A, Fritz A, Garrido-Oter R, Jørgensen TS, Shapiro N, Blood PD, Gurevich A, Bai Y, Turaev D, DeMaere MZ, Chikhi R, Nagarajan N, Quince C, Meyer F, Balvočiūtė M, Hansen LH, Sørensen SJ, Chia BKH, Denis B, Froula JL, Wang Z, Иган Р. , Канг Д.Д., Кук Дж.Дж., Делтел С., Бекстетт М., Леметр С., Петерлонго П., Ризк Дж., Лавениер Д., Ву Ю.В., Певица С.В., Джейн С., Строус М., Клингенберг Н., Мейнике П., Бартон М.Д., Лингнер Т. , Lin HH, Liao YC, Silva GGZ, Cuevas DA, Edwards RA, Saha S, Piro VC, Renard BY, Pop M, Klenk HP, Göker M, Kyrpides NC, Woyke T., Vorholt JA, Schulze-Lefert P, Rubin EM , Дарлинг А.Е., Раттей Т., Макхарди А.С.Критическая оценка интерпретации метагенома – эталон программного обеспечения метагеномики. Нат методы. 2017; 14 (11): 1063–71. https://doi.org/10.1038/nmeth.4458.

CAS Статья Google ученый

12

Awad S, Irber L, Brown CT. Оценка сборки метагенома на простом определенном сообществе с множеством вариантов штамма. 2017. https://www.biorxiv.org/content/early/2017/07/03/155358.

13

Коричневый CT. Восстановление штамма из метагеномов.Nat Biotechnol. 2015; 33 (10): 1041–3. https://doi.org/10.1038/nbt.3375.

CAS Статья Google ученый

14

Брито, Иллинойс, Альм Э. Дж. Отслеживание штаммов в микробиоме: выводы из метагеномики и моделей. Front Microbiol. 2016; 7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00712.

15

Alneberg J, Karlsson CMG, Divne A-M, Bergin C, Homa F, Lindh MV, Hugerth LW, Ettema TJG, Bertilsson S, Andersson AF, Pinhassi J.Геномы некультивируемых прокариот: сравнение геномов, собранных в метагеноме, и геномов с однократной амплификацией. Микробиом. 2018; 6 (1). https://doi.org/10.1186/s40168-018-0550-0.

16

Айва С., Дельмонт ТО, Рагидо С., Алнеберг Дж., Дарлинг А.Е., Коллинз Дж., Эрен А.М. DESMAN: новый инструмент для извлечения штаммов de novo из метагеномов. Genome Biol. 2017б; 18 (1). https://doi.org/10.1186/s13059-017-1309-9.

17

Найфах С., Родригес-Мюллер Б., Гаруд Н., Поллард К.С.Интегрированный метагеномический конвейер для профилирования штаммов выявляет новые модели бактериальной передачи и биогеографии. Genome Res. 2016; 26 (11): 1612–25. https://doi.org/10.1101/gr.201863. 115.

CAS Статья Google ученый

18

Гаррисон Э. Графическая пангеномика. Кандидатская диссертация: Кембриджский университет; 2018. https://doi.org/10.5281/zenodo.1463032. В представленном виде ожидает viva (защиты) и дальнейшей доработки.

19

Onate FP, Chatelier EL, Almeida M, Cervino ACL, Gauthier F, Magoules F, Ehrlich SD, Pichaud M.MSPminer: восстановление пангеномов микробов на основе метагеномных данных дробовика. Биоинформатика. 2018. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty830.

20

Petersen JM, Kemper A, Gruber-Vodicka H, ​​Cardini U, van der Geest M, Kleiner M, Bulgheresi S, Mußmann M, Herbold C, Seah BKB, Antony CP, Liu D, Belitz A, Weber M Хемосинтетические симбионты морских беспозвоночных животных способны к азотфиксации. Nat Microbiol. 2016; 2 (1). https://doi.org/10.1038/nmicrobiol.2016.195.

21

Олехнович Е.И., Васильев А.Т., Ульянцев В.И., Кострюкова Е. С., Тяхт А.В. MetaCherchant: анализ геномного контекста генов устойчивости к антибиотикам в кишечной микробиоте. Биоинформатика. 2017; 34 (3): 434–44. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx681.

Артикул Google ученый

22

Барнум Т.П., Фигероа И.А., Карлстрём К.И., Лукас Л.Н., Энгельбректсон А.Л., Коутс Дж.Д. Метагеномика с разрешением генома определяет генетическую подвижность, метаболические взаимодействия и неожиданное разнообразие сообществ, снижающих перхлораты.ISME J. 2018; 12 (6): 1568–81. https://doi.org/10.1038/s41396-018-0081-5.

CAS Статья Google ученый

23

Brown CT, Moritz D, O’Brien MP, Reidl F, Sullivan BD. spacegraphcats, версия 1.0. 2018. DOI: 10.5281 / zenodo.1478025.

24

Рейдл Ф. Структурная разреженность и сложные сети. 2016. http://publications.rwth-aachen.de/record/565064. Аахен, Техн. Hochsch., Diss., 2015.

25

Карп РМ.Сводимость комбинаторных задач. В кн .: Сложность компьютерных вычислений. Springer: 1972. стр. 85–103. https://doi.org/10.1007/978-1-4684-2001-2_9.

26

Хлебик, М., Хлебикова Й. Аппроксимационная трудность задач о доминирующем множестве в графах с ограниченной степенью. Inf Comput. 2008; 206 (11): 1264–75.

Артикул Google ученый

27

Дауни Р.Г., стипендиаты MR. Параметризованная сложность: Springer Science & Business Media; 2012 г.

28

де Мендес П.О. и др. Разреженность: графики, структуры и алгоритмы, том 28. 2012. https://doi.org/10.1007/978-3-642-27875-4.

29

Limasset A, Rizk G, Chikhi R, Peterlongo P. Быстрое и масштабируемое минимальное идеальное хеширование для массивных наборов ключей. CoRR. 017; абс. / 1702.03154. http://arxiv.org/abs/1702.03154.

30

Шакья М., Айва К., Кэмпбелл Дж. Х., Ян З. К., Шадт К. В., Подар М. Сравнительная характеристика метагеномного и рРНК микробного разнообразия с использованием синтетических сообществ архей и бактерий.Environ Microbiol. 2013a; 15 (6): 1882–99. ISSN 1462-2920. https://doi.org/10.1111/1462-2920.12086.

31

Ли Д., Луо Р., Лю С-М, Люнг С-М, Тинг Х.Ф., Садакане К., Ямасита Х., Лам Т-У. MEGAHIT v1.0: быстрый и масштабируемый ассемблер метагенома, основанный на передовых методологиях и практиках сообщества. Методы. 2016; 102: 3–11. https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2016.02.020.

CAS Статья Google ученый

32

Seah BKB, Gruber-Vodicka HR.gbtools: интерактивная визуализация бинов метагенома в r. Front Microbiol. 2015; 6. https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.01451.

33

Нурк С, Мелешко Д, Коробейников А, Певзнер П.А. metaspades: новый универсальный метагеномный ассемблер. Genome Res. 2017; 27 (5): 824–34.

CAS Статья Google ученый

34

Шарон И. , Кертес М., Хуг Л.А., Пушкарев Д., Блаувкамп Т.А., Кастель С.Дж., Амиребрахими М., Томас Б.К., Бурштейн Д., Триндж С.Г., Уильямс К.Х., Банфилд Дж.Ф.Точное считывание нескольких kb разрешает сложные популяции и обнаруживает редкие микроорганизмы. Genome Res. 2015; 25 (4): 534–43. https://doi.org/10.1101/gr.183012.114.

CAS Статья Google ученый

35

Ху П., Том Л., Сингх А., Томас BC, Бейкер Б.Дж., Пичено Ю.М., Андерсен Г.Л., Банфилд Дж.Ф. Метагеномный анализ с разрешением генома выявляет роли типов кандидатов и других членов микробного сообщества в биогеохимических преобразованиях в нефтяных коллекторах.mBio. 2016а; 7 (1). https://doi.org/10.1128/mbio.01669-15.

36

Стейнеггер М., Мирдита М., Содинг Дж. Сборка на уровне белка многократно увеличивает восстановление белковой последовательности из метагеномных образцов. 2018. https://doi.org/10.1101/386110.

37

Yang Y, Yooseph S. SPA: короткий пептидный ассемблер для метагеномных данных. Nucleic Acids Res. 2013; 41 (8): e91. https://doi.org/10.1093/nar/gkt118.

CAS Статья Google ученый

38

Parks DH, Imelfort M, Skennerton CT, Hugenholtz P, Tyson GW.CheckM: оценка качества микробных геномов, полученных из изолятов, отдельных клеток и метагеномов. Genome Res. 2015; 25 (7): 1043–55. https://doi.org/10.1101/gr.186072.114.

CAS Статья Google ученый

39

Ху П., Том Л., Сингх А., Томас BC, Бейкер Б.Дж., Пичено Ю.М., Андерсен Г.Л., Банфилд Дж.Ф. Метагеномный анализ с разрешением генома выявляет роли типов кандидатов и других членов микробного сообщества в биогеохимических преобразованиях в нефтяных коллекторах.MBio. 2016b; 7 (1): 01669–15. https://doi.org/10.1128/mBio.01669-15.

40

Demaine ED, Reidl F, Rossmanith P, Villaamil FS, Sik-dar S, Sullivan BD. Структурная разреженность сложных сетей: ограниченное расширение в случайных моделях и графах реального мира. J Comput Syst Sci. 2019; 105: 199–241. https://doi.org/10.1016/j.jcss.2019.05.004.

Артикул Google ученый

41

Надара В., Пилипчук М., Рабинович Р., Рейдл Ф., Зиберц С.Эмпирическая оценка алгоритмов аппроксимации для обобщенной раскраски графов и равномерной квазишироты. В: D’Angelo G, редактор. 17-й Международный симпозиум по экспериментальным алгоритмам, SEA 2018, 27-29 июня 2018 г., Л’Акуила, Италия, том 103 LIPIcs. Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum fuer Informatik: 2018. стр. 14: 1–16. https://doi.org/10.4230/LIPIcs.SEA.2018.14.

42

Marbouty M, Cournac A, Flot J-F, Marie-Nelly H, Mozziconacci J, Koszul R. Захват конформации метагеномной хромосомы (meta3c) раскрывает разнообразие хромосомной организации микроорганизмов.eLife. 2014; 3. https://doi.org/10.7554/elife.03318.

43

Beitel CW, Froenicke L, Lang JM, Korf IF, Michelmore RW, Eisen JA, Darling AE. Деконволюция синтетического метагенома на уровне штамма и плазмиды путем секвенирования продуктов лигирования близости. PeerJ. 2014; 2: e415. https://doi.org/10.7717/peerj.415.

Артикул Google ученый

44

Shakya M, et al. Сравнительная характеристика метагеномного и рРНК микробного разнообразия с использованием синтетических сообществ архей и бактерий.Environ Microbiol. 2013b; 15 (6): 1882–99. https://doi.org/10.1111/1462-2920.12086.

45

Zhang Q, Awad S, Brown CT. Пересечение потоков: структура для потокового анализа коротких чтений секвенирования ДНК. 2015. https://doi.org/10.7287/peerj.preprints.890v1.

46

Стендэдж Д., Яри А., Коэн Л.Дж., Крузо М.Р., Глава Т., Ирбер Л., Джослин С.К., Кингсли Н.Б., Мюррей К.Д., Нечес Р., Скотт К., Шин Р., Стейнбисс С., Сидней К., Браун СТ. khmer release v2.1: программа для анализа биологической последовательности.J Программное обеспечение с открытым исходным кодом. 2017; 2 (15): 272. https://doi.org/10.21105/joss.00272.

Артикул Google ученый

47

Чихи Р. , Лимассет А., Медведев П. Быстрое сжатие графиков де Брюйна из данных секвенирования с малым объемом памяти. Биоинформатика. 2016a; 32 (12): i201–8. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw279.

48

Стюарт К.А., Тернер Дж., Вон М., Гаффни Н.И., Кокерилл TM, Фостер И., Хэнкок Д., Торговец Н., Скидмор Е., Станция Д., Тейлор Дж., Тьюке С.Jetstream. В: Материалы конференции XSEDE 2015 года по научным достижениям на основе усовершенствованной киберинфраструктуры – XSEDE’15. ACM Press: 2015. https://doi.org/10.1145/2792745.2792774.

49

Towns J, Cockerill T, Dahan M, Foster I, Gaither K, Grimshaw A, Hazlewood V, Lathrop S, Lifka D, Peterson GD, Roskies R, Scott JR, Wilkens-Diehr N. XSEDE: ускорение научных исследований открытие. Comput Sci Eng. 2014; 16 (5): 62–74. https://doi.org/10.1109/mcse.2014.80.

Артикул Google ученый

50

Чихи Р., Лимассет А, Медведев П.Сжатие графиков Де Брёйна из данных секвенирования быстро и с малым объемом памяти. Биоинформатика. 2016b; 32 (12): i201–8.

51

Brown CT, Irber L, Cohen L. dib-lab / sourmash: v1.0. 2016. https://doi.org/10.5281/zenodo.153989.

52

Эдди С.Р., команда разработчиков HMMER. Hmmer v3.2.1. 2018. http://hmmer.org/. По состоянию на 8 мая 2020 г.

53

Finn RD, Coggill P, Eberhardt RY, Eddy SR, Mistry J, Mitchell AL, Potter SC, Punta M, Qureshi M, Sangrador-Vegas A, Salazar GA, Tate J, Bateman A .База данных семейств белков pfam: к более устойчивому будущему. Nucleic Acids Res. 2015; 44 (D1): D279–85. https://doi.org/10.1093/nar/gkv1344.

Артикул Google ученый

54

Katoh K, Standley DM. Программное обеспечение для множественного выравнивания последовательностей MAFFT, версия 7: Повышение производительности и удобства использования. Mol Biol Evol. 2013; 30 (4): 772–80. https://doi.org/10.1093/molbev/mst010.

CAS Статья Google ученый

55

Вестбрук А. , Рамсделл Дж., Шуэльке Т., Нормингтон Л., Бержерон Р.Д., Томас В.К., Макманес, доктор медицины.ПАЛАДИН: выравнивание белков для функционального профилирования данных о полном метагеноме. Биоинформатика. 2017; 33 (10): 1473–8. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx021.

CAS Статья Google ученый

56

Вик Р.Р., Шульц М.Б., Зобель Дж., Холт К.Э. Повязка: интерактивная визуализация ансамблей новогенома: Рис. 1. Биоинформатика. 2015; 31 (20): 3350–2. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv383.

CAS Статья Google ученый

57

Канехиса М., Сато Й., Моришима К.BlastKOALA и GhostKOALA: инструменты KEGG для функциональной характеристики последовательностей генома и метагенома. J Mol Biol. 2016; 428 (4): 726–31. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2015.11.006.

CAS Статья Google ученый

58

Костер Дж. , Рахманн С. Snakemake – масштабируемый механизм рабочего процесса биоинформатики. Биоинформатика. 2012; 28 (19): 2520–22. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts480.

Артикул Google ученый

59

Клюйвер Т., Раган-Келли Б., Перес Ф., Грейнджер Б. Е., Бюссонье М., Фредерик Дж., Келли К., Хамрик Дж. Б., Раут Дж., Корлай С. и др.Блокноты Jupyter – формат публикации для воспроизводимых вычислительных рабочих процессов. В: ELPUB. Нью-Йорк: IEEE: 2016. стр. 87–90.

Google ученый

60

van der Walt S, Varoquaux G. Массив NumPy: структура для эффективных численных вычислений. Comput Sci Eng. 2011; 13 (2): 22–30. https://doi.org/10.1109/mcse.2011.37.

Артикул Google ученый

61

Хантер ДжейДи.Matplotlib: среда 2D-графики. Comput Sci Eng. 2007; 9 (3): 90–5. https://doi.org/10.1109/mcse.2007.55.

Артикул Google ученый

62

McKinney W. pandas: базовая библиотека Python для анализа данных и статистики. Высокопроизводительные научные вычисления Python. 2011: 1–9.

63

Джонс Э., Олифант Т., Петерсон П. и др. SciPy: научные инструменты с открытым исходным кодом для Python. 2001. http://www.scipy.org/. По состоянию на 8 мая 2020 г.

64

Сатьянараян А., Мориц Д., Вонгсупхасават К., Хир Дж. Вега-лайт: грамматика интерактивной графики. IEEE Trans Vis Comput Graph. 2017; 23 (1): 341–50. https://doi.org/10.1109/tvcg.2016.2599030.

Артикул Google ученый

Инструкции по отлову – Коалиция диких кошек из Орегона

Устранение неполадок ловушки

Ловушка слишком чувствительна, когда я пытаюсь ее установить.

• Позвоните в склад ловушек, где вы подобрали ловушки, и получите другую.

• Положите немного бумаги в согнутую часть люка. Это делает дверь толще, а механизм захвата – менее чувствительным.

• Не устанавливайте ловушку для ловли кошки, если ловушка слишком чувствительна.

У меня несколько кошек, и я хочу поймать одну.

• Получите достаточно ловушек для каждой кошки в колонии. Поймайте всех кошек и удерживайте их в ловушках, пока не поймаете оставшихся кошек. Как только вы поймаете целевую кошку, отпустите других пойманных кошек. Не используйте эту технику для отлова и освобождения незакрепленных кошек.

• Используйте «трюк с бутылкой воды». Вместо того, чтобы устанавливать ловушку в обычном режиме, подпереть люк приоткрытым предметом, например бутылкой с водой. Привяжите к объекту веревку длиной более 20 футов, а затем подождите, пока целевая кошка полностью войдет в ловушку и начнет есть. Потяните за веревку, чтобы люк быстро закрылся за кошкой.

• Используйте каплеуловитель. Это большая коробчатая ловушка, которая падает вокруг целевой кошки.Вы должны присутствовать, чтобы использовать эту ловушку. Позвоните в офис FCCO, чтобы узнать о наличии.

• Используйте пульт дистанционного управления и ловушку. Это позволяет вам сработать ловушку только тогда, когда целевая кошка находится внутри, и вы нажимаете кнопку на пульте дистанционного управления. Позвоните в офис FCCO, чтобы узнать о наличии.

Я травил ловушки более трех дней, и кошки не будут есть внутри ловушек.

• Есть ли у кошек доступ к пище вне ловушек от вас или от соседа?

  • Если у вас есть еда, доступная для кошек вне ловушек, у кошек нет мотивации есть внутри ловушек.Убирайте остатки пищи, находящейся вне ловушек, включая сухой корм.

  • Если вы подозреваете, что сосед может кормить кошек, поговорите с ним и попросите его убрать еду, пока вы пытаетесь поймать кошку.

• Используйте вонючую пищу, чтобы заманить кошек в ловушки. Хороший выбор – тунец, курица KFC, сардины, скумбрия и пахнущая влажная еда.

• Возьмите одну из наших больших ловушек с прозрачной дверцей. Это заставляет кошек думать, что оба конца люка открыты.

• Используйте каплеуловитель. Это большая коробчатая ловушка, которая падает вокруг целевой кошки (кошек). Вы должны присутствовать, чтобы использовать эту ловушку. Позвоните в офис FCCO, чтобы узнать о наличии.

Кошки переступают через опорную тарелку, чтобы поесть, или кошки могут вытащить корм, не срабатывая ловушки.

• Используйте «трюк с бутылкой воды». Вместо того, чтобы устанавливать ловушку в обычном режиме, подпереть люк приоткрытым предметом, например бутылкой с водой.Привяжите к объекту веревку длиной более 20 футов, а затем подождите, пока целевая кошка полностью войдет в ловушку и начнет есть. Потяните за веревку, чтобы дверь за кошкой быстро закрылась.

• Свяжите курицу внутри задней части ловушки в верхнем углу. Это изменит то, как кошка должна стоять в ловушке, и не даст ей вытащить корм.

• Сложите газету так, чтобы она доходила до конца опорной пластины. Положите немного еды на кусок бумажной тарелки и поставьте ее на дно ловушки, минуя тарелку срабатывания и газету.Кошке придется тянуться дальше, чтобы поесть, и она не сможет вытащить корм.

Кошки не едят регулярно.

• Вы всегда оставляете еду вне дома? Попробуйте кормить в течение меньшего промежутка времени в течение дня. Продолжайте сокращать это временное окно до тех пор, пока кошки не научатся приходить в течение 1 часа, чтобы поесть.

• Поговорите со своими соседями, чтобы узнать, едят ли кошки где-нибудь еще по соседству.Многие кошки переключаются между несколькими кормушками. Попросите их временно прекратить кормить кошек, пока вы пытаетесь отловить и стерилизовать / стерилизовать, или спросите, можно ли поставить ловушки там, где они обычно кормят кошек.

Catio Открытый вольер для кошек | Большой безопасный вольер для кошек

Вольер для кошек Catio, опубликованный в журнале Your Cat Magazine

Catio – это большой и безопасный вольер для кошек, который позволяет вам с комфортом проводить время с кошкой на открытом воздухе.

Красиво оформленный темно-зеленый вольер Catio будет отлично смотреться на вашем заднем дворе

Вы можете создать очень просторный уличный вольер для кошек с простым добавлением надставок

Высота вольера для кошек Catio Outdoor позволяет вам пройти внутрь и провести время со своими кошками

Если у вас есть домашняя кошка, им понравятся сенсорные ощущения от выхода на улицу в вольер Catio

Вы можете добавить аксессуары к вольеру для бега на открытом воздухе, чтобы кошка могла расслабиться, спать и играть

Вольер для кошек Catio Outdoor больше, чем большинство вольеров для кошек, и его можно расширить в соответствии с вашими требованиями

Идеально подходит для владельцев породистых или домашних кошек, уличный вольер для кошек Catio одобрен ведущими заводчиками кошек со всего мира

Вольер для кошек Catio Outdoor прост в сборке и подходит для использования в любое время года

IL HB1711 | 2021-2022 | 102-я Генеральная Ассамблея

2021-03-11 2021-02-19 Подано клерку представителем Барбарой Эрнандес

2021-08-27	Дом	Государственный закон. . . . . . . . . 102-0586
2021-08-27	Дом	Дата вступления в силу 23 февраля 2022 г. Дом	Направлено губернатору
2021-05-31	Дом	Сдано Оба дома
2021-05-31	Сенат	Третье чтение – Принято; 038-012-004
2021-05-28	Сенат	Помещено в календаре Порядок 3-го чтения 29 мая 2021 г.
2021-05-28	Сенат	Второе чтение
2021-05-27	Сенат	Помещено в календарь Порядок 2-го чтения
2021-05-27	Сенат	Разрешить сельское хозяйство; 012-001-000
2021-05-21	Сенат	Правило 2-10 Срок полномочий Комитета установлен 29 мая 2021 года
2021-05-20	Сенат	Назначено на сельское хозяйство
2021-05-11	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора Сенат. Майк Симмонс
2021-05-07	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора Сенат Жаклин И. Коллинз
2021-05-06	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора Сенат. Лаура Файн
05.05.2021	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора Сенат Джули А. Моррисон
2021-04-29	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора Сенат. Джон Коннор
2021-04-26	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора Сенат.Адриан Джонсон
2021-04-23	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора Сенат Дорис Тернер
2021-04-20	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного главного со-спонсора Сенат Карина Вилла
2021-04-20	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного главного со-спонсора сенатор Сара Фейгенхольц
2021-04-20	Сенат	Добавлен в качестве альтернативного со-спонсора сенатор Джон Ф. .Курран
2021-04-19	Сенат	Передано по поручениям
2021-04-19	Сенат	Первое чтение
2021-04-19 Добавлено	Сенат	Сенат	Заместитель главного со-спонсора сенатора Линда Холмс
19.04.2021	Сенат	Главный спонсор сената сенатор Кристина Кастро
19.04.2021	Сенат	Помещено в календарь Порядок первого Чтение
2021-04-19	Сенат	Прибытие в Сенат
2021-04-16	Дом	Ходатайство о пересмотре голосования – Снято респ.Эндрю С. Чесни
2021-04-14	House	Добавлен со-спонсор Энтони ДеЛука
2021-04-14	House	Добавлен со-спонсор представитель William Davis
2021-04-14	House	Ходатайство о пересмотре голосования Представитель Эндрю С. Чесни
2021-04-14	House	Третье чтение – короткие дебаты – принято 076-024-002
2021-04-14	Дом	Удаленный со-спонсор Представитель.Thomas M. Bennett
2021-04-14	House	Добавлен со-спонсор Представитель Deanne M. Mazzochi
2021-04-13	House	Дата размещения в календаре Порядок 3-го чтения – Краткие дебаты
2021-04-13	Дом	Поправка № 1 по этажу Дома Принята
2021-04-13	Дом	Второе чтение – Краткое обсуждение
2021-04- 06	Дом	Этаж дома Поправка No.1 Комитет по правилам рекомендует быть принятым; 005-000-000
2021-03-26	House	Добавлен представитель со-спонсора Michelle Mussman
2021-03-25	House	Добавлен со-спонсор Представитель Тереза ​​Мах	2021-03-24	Дом	Этаж дома Поправка No. 1 Подано клерку представителем Эндрю С. Чесни
23.03.2021	Дом	Добавлен со-спонсор Представитель Томас М. Беннет
23.03.2021	Дом	Добавлен Представитель со-спонсора Дженнифер Гонг-Гершовиц
23.03.2021	House	Добавлен представитель со-спонсора Робин Гэйбл
22.03.2020	House	Добавлен со-спонсор . Райан Испания
2021-03-19	Дом	Добавлен со-спонсор Представитель.Terra Costa Howard
2021-03-18	House	Добавлен представитель со-спонсора Дэвид А. Велтер
2021-03-18	House	Добавлен представитель со-спонсора Грег Харрис
2021-03-18	House	Добавлен со-спонсор представитель Кэтлин Уиллис
2021-03-18	House	Добавлен со-спонсор представитель Майк Мерфи
2021-03 2021-03 -18	House	В календаре 2-е чтение – короткие дебаты
2021-03-17	House	Добавлен со-спонсор Представитель. Джанет Янг Рор
2021-03-15	Дом	Пройдите / Короткие дебаты Комитет защиты прав потребителей; 005-001-000
2021-03-15	House	Добавлен представитель со-спонсора Джеки Хаас
2021-03-12	House	Добавлен представитель со-спонсора Дэйв Велла
2021-03-12	House	Добавлен представитель со-спонсора Мартин Маклафлин
2021-03-11	House	Удаленный представитель со-спонсораЭми Грант
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор Маргарет Кроук
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор Представитель Келли М. Кэссиди
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор представитель Энн М. Уильямс
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор представитель Chris Bos
2021- 03-11	House	Добавлен со-спонсор Rep. Anna Moeller
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор Представитель Anne Stava-Murray
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор представитель Will Guzzardi
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор представитель Мартин Дж. Мойлан
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор Тим Батлер
2021- 03-11	House	Добавлен со-спонсор Rep.Марк Батиник
2021-03-11	House	Добавлен представитель со-спонсора Тони МакКомби
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор Боб Морган
House	Добавлен со-спонсор представитель Amy Grant
2021-03-11	House	Добавлен со-спонсор Seth Lewis
2021-03-11	House	Добавлен представитель главного со-спонсора. Морис А. Вест, II
2021-03-10	House	Добавлен представитель со-спонсора Daniel Didech
2021-03-10	House	Добавлен главный со-спонсор Rep. Barbara Эрнандес
2021-03-10	House	Главный спонсор изменен на представителя Эндрю С. Чесни
2021-03-09	House	Назначен Комитету по защите прав потребителей
03-08	House	Добавлен со-спонсор Rep.Рита Мэйфилд
2021-03-02	House	Добавлен со-спонсор Представитель Маура Хиршауэр
2021-02-24	House	Добавлен со-спонсор Представитель Джойс Мейсон
House	Добавлен главный со-спонсор представитель Эндрю С. Чесни
2021-02-18	House	Добавлен главный со-спонсор представитель Deb Conroy
2021- 02-18	House	Добавлен главный со-спонсор Представитель. Джонатан Кэрролл
2021-02-17	Дом	Направлено в Комитет по правилам
2021-02-17	Дом	Первое чтение
2021-02-11	Дом

Новая сборка генома домашней кошки, основанная на считывании длинной последовательности, расширяет возможности геномной медицины кошек и определяет новый ген карликовости.

Abstract

Домашняя кошка (Felis catus) насчитывает более 94 миллионов только в США, живет в домашних условиях в качестве домашнего животного и, как и люди, страдает раком, а также обычными и редкими заболеваниями.Однако для этого вида информация о вариантах последовательностей в масштабе всего генома ограничена. Для расширения возможностей анализа признаков была разработана новая эталонная сборка генома кошки на основе длинных считываний последовательностей PacBio, которые значительно улучшают представление последовательности и целостность сборки. Последовательности полных геномов 54 домашних кошек были сопоставлены с эталоном для идентификации однонуклеотидных вариантов (SNV) и структурных вариантов (SV). У всех кошек 16 SNV, по прогнозам оказывающие вредное воздействие, в одноэлементном состоянии были определены как высокоприоритетные кандидаты на причинные мутации.Одним из кандидатов был стоп-фактор в супрессоре опухолей FBXW7. SNV обнаруживается у кошек с сегрегацией по поводу лимфомы средостения кошек и является кандидатом на наследственную предрасположенность к раку. Анализ SV выявил сложную делецию в сочетании с близлежащим потенциальным событием дупликации, которое было частным образом разделено между тремя неродственными кошками с карликовостью и обнаружено в пределах известной области, связанной с карликовостью, на кошачьей хромосоме B1. Этот SV прервал UDP-глюкозо-6-дегидрогеназу (UGDH), ген, участвующий в биосинтезе гликозаминогликанов.Важно отметить, что UGDH еще не был связан с карликовостью человека и должен быть проверен у недиагностированных пациентов. Новый высококачественный эталон генома кошки и компиляция вариаций последовательностей демонстрируют важность этих ресурсов при поиске аллелей, вызывающих заболевание, у домашних кошек и для идентификации биомедицинских моделей кошек.

Многие научные публикации, созданные UC, находятся в свободном доступе на этом сайте из-за политики открытого доступа UC. Сообщите нам, насколько этот доступ важен для вас.

Основное содержание

Загрузить PDF для просмотраПросмотреть больше

Больше информации Меньше информации

Закрывать

Введите пароль, чтобы открыть этот PDF-файл:

Отмена Ok

Подготовка документа к печати…

Отмена

Ресурс секвенирования всего экзома домашней кошки для обнаружения признаков

Фенотипическая когорта

WES была проведена на 41 индивидуальной кошке, представляющей множество различных заболеваний и признаков, некоторые с известными аллелями болезней (Таблица 1). 41 кошку можно далее разделить на две отдельные когорты: первая – это первые десять кошек, у которых было девять известных вариантов по различным заболеваниям и эстетическим признакам, например, по цвету шерсти и типу меха. Эти 10 кошек также соответствовали данным WGS, которые использовались для оценки эффективности WES. Вторая когорта из 31 представляет генетически не охарактеризованных кошек. Эти кошки представляли 11 разных пород, в том числе 14 кошек случайного происхождения. Группы кошек с аналогичным генетическим прошлым использовались для оценки причин лимфомы средостения, судорожного расстройства, колобом век, гипотиреоза, гиповитаминоза D, голубых глаз породы Охос Азулес и курчавой шерсти Теннесси Рексов.У пяти кошек были сердечные заболевания, в том числе гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП). В исследуемой популяции представлены по крайней мере семь неврологических расстройств, обычно представляющих собой новые проявления у кошек случайного происхождения. В целом у 41 кошки было примерно 31 случай неизвестного заболевания.

Таблица 1 Описание и болезни 41 кошки для оценки WES.

Покрытие последовательностей и специфичность

Чтобы оценить эффективность этого ресурса экзома кошек, были получены данные WES с глубоким охватом для десяти кошек с данными WGS для сравнения.После сопоставления с Felis_catus_9.0, обрезки базового качества и удаления дубликатов ПЦР средний процент считываний, сопоставленных однозначно, составил 82% (таблица 2). Средняя глубина секвенирования составляла 267 × с диапазоном от 76 × до 458 × (дополнительная таблица 2, дополнительные данные S1). При оценке глубины охвата из 201 683 экзонных мишеней 98,1% совпадают с охватом> 20 ×. В среднем 6,98% от общего числа считываний выровнены за пределами целевых областей генома. (Дополнительная таблица 2, дополнительные данные S1).Для не охарактеризованного экзома 31 кошки глубина секвенирования была скорректирована в соответствии с типичными исследованиями WES на людях; для этой группы кошек мы оценили среднюю глубину покрытия в 80 ×. 96,41% экзонных мишеней выровнены с охватом> 20 ×, в диапазоне от 91 до 98%. В среднем 10,41% от общего числа считываний, выровненных с отклонением от цели, немного выше по сравнению с первыми 10 кошками с более высоким охватом, что можно отнести к более низкой глубине секвенирования в большей когорте. Как и ожидалось, при более низкой глубине покрытия в целом наблюдается сокращение картографирования; например, при 40 × 93.Было покрыто 5% целевых баз (Рис. 1), и наоборот, 99% покрыты в 2 раза.

Таблица 2 Сводка показателей по обеим когортам. Рисунок 1

Доля оснований, покрытых зондами захвата экзома. Первоначальные 10 образцов окрашены в красный цвет, а ось X показывает глубину покрытия, которая показывает, сколько раз покрывается нуклеотидное основание, начиная с глубины 10x и увеличиваясь до 50x.

Обнаружение вариантов на основе платформы и связанные с ними предубеждения

Варианты были разделены на варианты, обнаруженные с использованием платформ WES и WGS, и варианты, относящиеся исключительно к одной платформе. Затем оба набора были отфильтрованы по качеству, типу варианта (SNV или indel) и двуаллельному статусу. Для вариантов с высокой степенью воздействия, вызывающих потерю функции в гене, WES и WGS идентифицировали 582 и 617 SNV соответственно, при этом 97,8% SNV WES также были идентифицированы WGS и 92,1% SNV WGS также идентифицированы WES (Таблица 3). . Наиболее распространенными классами вариантов, идентифицированными исключительно WGS, были донорные / акцепторные сайты сплайсинга и стоп-прирост; однако общее количество этих вариантов было низким, от 3 до 19 полных вариантов.Варианты умеренного (несмыслового) и низкого (синонимичного) воздействия имели высокую согласованность между наборами данных WES и WGS, в диапазоне от 94,7% для SNV 3′-нетранслируемой области в WGS до 100% для большинства SNV, идентифицированных WES (Таблица 4). В целом, только небольшая часть SNV (WES = 834 и WGS = 2194) была эксклюзивной для конкретной платформы (рис. 2a). Принимая во внимание индели, идентифицированные вызывающим гаплотипом, данные WES и WGS имели более низкую согласованность, чем SNV (Таблица 5). Хотя WES обнаружил 1739 высокоэффективных дефектов, а WGS – 1931, процент обычно идентифицируемых и эксклюзивных инделений показал больше различий между категориями последствий, чем SNV.И для SNV, и для инделей те, которые были классифицированы как высокоэффективные, представляют собой непропорционально большое количество эксклюзивных вариантов платформы. На обеих платформах каждая отдельная кошка несла в общей сложности приблизительно 80 000 SNV в областях-мишенях экзома (рис. 2b). Что касается исключительных для платформы SNV, количество WGS SNV было повышено по сравнению с подсчетом WES SNV, а также показало более высокие уровни вариабельности между людьми (рис. 2c).

Таблица 3 Независимые подсчеты последствий WES по сравнению с WGS, определенные с помощью предиктора вариантного эффекта. Таблица 4 Количество последствий SNV для WES по сравнению с WGS, как определено с помощью предиктора вариантного эффекта. Рисунок 2

Статистика вызова вариантов для 10 кошек, секвенированных на обеих платформах. ( a ) Диаграммы Венна, показывающие количество эксклюзивных и распространенных вариантов для каждой платформы. Темно-красный текст указывает количество вариантов, найденных в WES, а черный текст указывает количество вариантов, найденных в WGS. Причина, по которой количество общих вариантов различается между платформами, заключается в том, что общие варианты были идентифицированы до фильтрации.( b ) Количество SNP, обнаруженных в каждой выборке на обеих платформах. ( c ) Процент SNP, обнаруженных как эксклюзивные для каждого образца для каждой платформы. Первая, третья, восьмая и десятая выборки – мужчины. Все остальные образцы женские. ( d ) Распределение количества аллелей для общих и эксклюзивных SNP на обеих платформах. SNP WES показаны вверху, а SNP WGS – в перевернутом виде внизу. Кроме того, также показано отношение Ti / Tv для наборов SNP.

Таблица 5 Средние SNV на особь для десяти кошек WES и WGS.

Еще один метод характеристики SNV, эксклюзивных для платформы, – это измерение их распределений по количеству аллелей. Количество аллелей SNV, эксклюзивных для WES, было сильно смещено в сторону количества аллелей, равного единице (рис. 2d). Используя SNV, найденные на обеих платформах, в качестве стандарта для сравнения, эксклюзивное распределение количества аллелей WES согласуется с SNV, идентифицированными случайной ошибкой, поскольку большинство этих SNV появляется в наборе данных только один раз. Более того, этот результат отражается в отношениях Ti / Tv каждого набора данных, соотношении переходов к количеству трансверсий, которое используется в качестве индикатора качества для SNV.SNV WES, обнаруженные на обеих платформах, имеют отношение Ti / Tv 3,92, что указывает на низкую концентрацию ложноположительных вариантных сайтов, в то время как эксклюзивные SNV WES имеют отношение 1,52, что указывает на высокую концентрацию ложноположительных вариантных сайтов. С другой стороны, количество аллелей для SNV, исключительных для WGS, имеет два пика. Первый имеет количество аллелей, равное единице, что аналогично исключительным SNV WES, а второй – количество аллелей, равное четырем, что наводит на мысль о более систематической ошибке при обнаружении вариантов. Этот второй пик для эксклюзивных SNV WGS, вероятно, согласуется с повышенным уровнем обнаружения эксклюзивных вариантов WGS, наблюдаемым у самцов кошек, и может указывать на проблемы, возникающие из-за отсутствия Y-хромосомы в использованной эталонной сборке.Для SNV WGS отношения Ti / Tv как для исключительных, так и для неисключительных SNV аналогичны SNV WES, где эксклюзивные SNV обогащены для ложноположительных вариантных сайтов.

Чтобы выявить предвзятость к конкретным генам с использованием платформ WGS и WES, количество вариантов на ген сравнивали между результатами WGS и WES (дополнительные данные S2). При сравнении вариантов, обнаруженных WGS и WES, большое количество генов содержало 20 или более вариантов, обнаруженных WGS (рис. 3). Чтобы исследовать причину этих выбросов, для дальнейшего анализа были отобраны 50 основных аномальных генов (дополнительные данные S3).Из них 14 генов были обнаружены на Х-хромосоме, что позволяет предположить, что различия в обнаружении вариантов могут соответствовать увеличенному количеству исключительных SNV для WGS у мужчин, наблюдаемых на рис. 2c (дополнительные данные S3). Помимо обогащения на хромосоме X, еще один кластер из 13 генов с WGS-смещенным обнаружением вариантов был расположен на хромосоме D1. Эти гены были в основном обонятельными рецепторами, которые обычно принадлежат к большим семействам генов со многими паралогами и псевдогенами, что, вероятно, приводит к усилению нецелевых эффектов.Другой примечательный ген, LOC101099449, содержал 713 т.п.н. целевой последовательности. При более тщательном анализе, целевая последовательность LOC101099449 перекрывала весь лямбда-локус иммуноглобулина, область, которая обычно сильно варьируется у разных людей. Все остальные гены с WGS-предвзятым обнаружением вариантов были распределены по всему геному.

Рисунок 3

Генная предвзятость платформы. Каждая отдельная точка на диаграмме рассеяния представляет собой ген, ось Y показывает различия в количестве SNP на ген.Гены с большим количеством SNP WGS, чем SNP WES, имеют положительные значения, тогда как гены имеют отрицательные значения, когда вместо них имеется больше SNP WES. Ожидаемое количество SNP рассчитывается как среднее количество SNP на ген на обеих платформах и отображается в логарифмической шкале.

Для дальнейшего исследования увеличения обнаружения вариантов на хромосоме X, обусловленного WGS, сравнивали среднее количество вариантов на индивидуум между мужчинами и женщинами (Таблица 5). Для аутосом и платформ секвенирования процентные различия по полу были относительно низкими и составляли от 7 до 10%.С другой стороны, по обеим группам генов процентная разница между полами на Х-хромосоме была намного выше. Для 50 наиболее выделяющихся генов WGS обе платформы показали примерно 98% -ную разницу по полу, тогда как все гены показали 61% -ную разницу по полу для WGS и 45% -ную разницу по полу для WES. Поскольку процентное различие полов в генах-выбросах одинаково на обеих платформах, результаты показывают, что смещение платформы на хромосоме X более вероятно из-за повышенного обнаружения вариантов в этих регионах, а не из-за разницы в способностях платформ обнаруживать варианты у обоих полов. Важно отметить, что фактическое количество половых различий в хромосоме X на обеих платформах одинаково для разных групп генов. В топ-50 выбросов WGS разница между средними значениями SNV мужчин и женщин по хромосоме X составляет 1340,92, в то время как по всем генам X-хромосомы эта же разница равна 1202,5 ​​(таблица 5).

Чтобы изучить потенциальное перекрытие между предвзятостью платформы и пола, было проанализировано распределение SNV на ген вдоль хромосомы X. Гены, ориентированные на платформу, сгруппированы между позициями от 15 до 70 Mb (рис.4а). На обеих платформах эти гены также имеют самую высокую концентрацию SNV с> 20 SNV на тысячу килограммов кодирующей последовательности (рис. 4a). Альтернативно, большинство генов за пределами этой области имеют концентрации SNV <5 SNV на kb кодирующей последовательности. Что касается предвзятости по признаку пола, хотя общая процентная разница между платформами одинакова (таблица 5), отдельные гены демонстрируют исключительную вариабельность по величине эффекта для каждой платформы. Например, выявление смещенных к самцам вариантов для каждого гена чаще наблюдалось для WGS (рис.4б). Однако, несмотря на эту вариацию между платформами, гены с повышенным предвзятым отношением к полу были теми же генами с повышенным предвзятым отношением к платформе (дополнительные данные S4). Следовательно, на хромосоме X предубеждения платформы и предубеждения по полу при обнаружении SNV кажутся смешанными, поскольку многочисленные факторы в рамках одних и тех же генов относительно согласованы на обеих платформах, оба предубеждения, вероятно, имеют схожую основную причину, по-разному выраженную на каждой платформе.

Рисунок 4

Распределение SNP на ген вдоль хромосомы X.( a ) Общее количество SNP на килобайт кодирующей последовательности на ген. ( b ) Обнаружение вариантов с учетом пола по хромосоме X. Смещение рассчитывается как кратное изменение среднего числа SNP на индивидуум на ген для мужчин и женщин. В частности, это было рассчитано для каждого гена как log2 ((средние мужские SNP + 1) / (средние женские SNP + 1)). Они были добавлены для удаления неопределенных результатов, вызванных делением на число 0.

Потенциальная причина предвзятости по признаку пола при открытии вариантов заключается в том, что смещенные гены имеют деградированные копии на Y-хромосоме.Для десяти известных генов Х-хромосомы кошек с деградированными копиями Y ¹⁹ были рассчитаны общее количество SNV на платформу и среднее количество SNV на человека. Из этих десяти генов девять имеют более чем 11 исключительных различий в отношении платформы в открытии SNV и, следовательно, входят в число 50 генов-исключений для исключительной предвзятости платформы (дополнительная таблица 4). Более того, почти все SNV, обнаруженные в этих генах, были обнаружены только у мужчин, независимо от платформы. Для WGS было в среднем 1169.У мужчин обнаружено 25 SNV, а у женщин – всего 7,83. Для WES цифры были аналогичными: в среднем 774,5 SNV у мужчин и в среднем 7,83 SNV у женщин (дополнительная таблица 4). Вместе эти результаты указывают на то, что большая часть предвзятости по полу при обнаружении вариантов происходит из-за отсутствия Y-хромосомы в сборке Felis_catus_9.0.

Проверка известных вариантов

Для дальнейшего анализа эффективности WES для обнаружения вариантов мы исследовали каждый образец на наличие известных вариантов, вызывающих признаки.Аннотацию гена Felis_catus_9.0 Ensembl release 99 использовали с выбором экзонов с +/- 30 п.н., чтобы соответствовать дизайну захвата экзома, и варианты просматривали с помощью программного обеспечения VarSeq (GoldenHelix, Inc). Большинство из 115 ранее опубликованных вариантов, вызывающих признаки у домашней кошки, которые были задокументированы как причинные для болезней и признаков, влияют либо на кодирующие области, либо на донорский / акцепторный сайт сплайсинга ¹⁶ . Из этих известных вариантов 44 были идентифицированы в нашей когорте WES.Были идентифицированы все варианты окраски шерсти и болезней, которые, как ожидается, будут присутствовать у десяти кошек, включая аллели в локусах для Агути ( ASI P — a ²⁰ ), коричневого ( TYRP1 —b ²¹ ), Окрас ( TYR —cs ²² ), густой ( MLPH —d ²³ ), длинношерстный ( FGF5 —I ²⁴ ), Lykoi ( HR —hrTN, hrVA ²⁵ ) Бенгальская прогрессирующая дегенерация сетчатки ( KIF3B ²⁶ ) и персидская прогрессирующая дегенерация сетчатки ( AIPL1 ¹⁷ ), гидроцефалия ( GDF7 ²⁷ ) и другие (дополнительные данные S5).У кошек также были варианты, влияющие на группу крови кошек ^28,29 . В соответствии с ограничениями нашего дизайна захвата экзома кошек, не было обнаружено ни известных структурных, ни интронных вариантов. При анализе дискордантных чтений в образце карлика WGS делеция и перестройка, указывающие на структурный вариант (SV), были видны в гене UDGH ¹⁷ , но несогласованность чтения не была обнаружена в анализе WES (дополнительный рисунок 1). Кроме того, KIT интронного SV для White и Spotting не были идентифицированы ³⁰ .Следовательно, подход WES не сможет идентифицировать многие сложные SV, что является важным ограничением, которое следует учитывать при будущих усилиях по обнаружению черт кошек.

Открытие нового варианта-кандидата

Новые варианты ДНК были исследованы как предположительно причинные для болезней и признаков у 33 кошек. Новая мутация сдвига рамки считывания в полицистине 2 ( PKD2 ³¹ ), гене, связанном с поликистозом почек (PKD), как было предсказано, нарушает функцию белка у сибирской кошки, которая, как показало ультразвуковое исследование, имеет PKD.Эта мутация, делеция одного основания, вызывает усеченный белок (p.Lys737Asnfs * 2). Этот вариант был гетерозиготным у пораженной кошки и уникальным для данных экзома и не был идентифицирован в когорте из 195 кошек из набора данных варианта 99 жизней ³² . Этот вариант также был выявлен у обоих дедушек и бабушек со стороны матери, хотя УЗИ почек не проводилось. Однако анализ других сибирских кошек с PKD, диагностированной с помощью ультразвука, не смог идентифицировать вариант c.2211delG в PKD2 , что позволяет предположить, что это может быть частный вариант и что другие вызывающие болезнь варианты PKD еще не обнаружены у этой породы.

Вариант гена рецептора 6 лизофосфатидной кислоты ( LPAR6 ), связанный с аутосомно-рецессивным рексоидным (Marsella wave) шерстью породы корниш-рекс, был обнаружен у петерболдской кошки, которая является голой породой ³³ . Тем не менее, бесшерстность считается аутосомно-доминантной у заводчиков кошек. Аннотация предсказывает, что c.249delG вызовет p.Phe84Leufs * 10; следовательно, этот петерболд, вероятно, является сложной гетерозиготной по двум мутациям, сопоставимым в LPAR6.Этот вариант был гетерозиготным у пораженной кошки, уникальным для данных экзома и не идентифицирован в наборе данных вариантов 99 жизней.

Также был повторно идентифицирован известный вариант заболевания кошек (дополнительные данные S5) ³² . Вариант 1 из 3 членов семейства носителей растворенного вещества ( SLC3A1 ) был гомозиготным у греческой кошки с цистинурией. Вариант c.1342C> T, вызывающий p.Arg448Trp в позиции A3: 66539609, был ранее задокументирован как связанный с этим условием ³⁴ .Ни у одной другой кошки в наборе данных экзома не было этого варианта. Многие из вариантов, связанных с кошачьей группой крови B и ее расширенным гаплотипом, были обнаружены у 11 кошек, предполагая, что пять кошек относятся к типу B, одна была подтверждена ²⁸ . Были обнаружены варианты в APOBEC3 , который связан с инфекцией вируса иммунодефицита кошек (FIV) у кошек, и у трех кошек была аллельная комбинация, продуцирующая гаплотип аминокислоты IRAVP, который связан с устойчивостью к FIV ³⁵ .